Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cabp4Q8VHC5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms