Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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