Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms