Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy2Q8R4C2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms