Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd300eQ8K249 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300eQ8K249 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300eQ8K249 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300eQ8K249 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300eQ8K249 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms