Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms