Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Glis1Q8K1M4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms