Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sde2Q8K1J5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms