Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh3Q8K1E6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh3Q8K1E6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms