Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbrd1Q8K0B2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms