Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms