Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz3Q8CGV9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tshz3Q8CGV9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms