Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms