Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup88Q8CEC0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms