Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms