Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo43Q8CDI2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo43Q8CDI2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo43Q8CDI2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms