Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vwc2Q8C8N3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms