Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc90bQ8C3X2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms