Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh12Q8BYK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh12Q8BYK4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh12Q8BYK4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms