Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Triml1Q8BVP1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms