Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms