Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tyw3Q8BSA9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tyw3Q8BSA9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms