Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm10600Q8BQ57 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10600Q8BQ57 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10600Q8BQ57 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms