Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gpc2Q8BKV1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc2Q8BKV1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms