Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pknox2Q8BG99 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms