Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms