Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfascQ810U3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfascQ810U3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NfascQ810U3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfascQ810U3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfascQ810U3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfascQ810U3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfascQ810U3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfascQ810U3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NfascQ810U3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms