Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChfrQ810L3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms