Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms