Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms