Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2q1Q7TSS2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms