Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms