Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms