Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd3Q7TM95 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tigd3Q7TM95 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms