Protein–RNA interactions for Protein: Q791N7

Znrd1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrd1Q791N7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms