Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScocQ78YZ6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms