Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GypcQ78HU7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GypcQ78HU7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms