Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SpopQ6ZWS8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms