Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chsy1Q6ZQ11 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms