Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zc3h4Q6ZPZ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms