Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm3bQ6ZPY7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms