Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms