Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b3Q6UQ17 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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