Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scgb2b2Q6UGQ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms