Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms