Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf1cQ6PDZ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms