Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Herc4Q6PAV2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Herc4Q6PAV2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms