Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc189Q6NZQ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms