Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms