Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asic1Q6NXK8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asic1Q6NXK8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms